Pymol
Pymol
PyMOL is a molecular
graphics system with an embedded Python interpreter designed for real-time
visualization and rapid generation of high-quality molecular graphics images
and animations. It can also perform many other valuable tasks (such as editing
PDB files) to assist you in your research.
Dengan menggunakan aplikasi ini kita akan dengan mudah mengetahui bentuk
molekul, Van der Walls radius, hingga mesh yang dimiliki oleh suatu molekul.
Berikut cara mudahnya
:
Pertama kita harus
membuka aplikasinya, akan muncul 2 tampilan yaitu Molecular Graphic System
dan Pymol Viewer.
Klik toolbar build
pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan, missal kita
pilih fitur Residue → Alanine.
kemudian apabila anda
ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih fitur-fitur yang ada di
sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge kita bisa pilih fitur
L-toolbar → other properties → formal charge
jika ingin mengetahui
Van der Walls radius tinggal pilih L-toolbar → vdw radius
untuk mengetahui
symbols pilih L-toolbar → element symbol
pilih S-toolbar →
dots
dan kemudian jika
ingin mengetahui mesh dan surface pilih S-toolbar→ mesh dan S-toolbar →
surface
Get view dan kemudian
Orient
Mudah bukannnn???
Selamat Mencoba dan
Terima Kasih :)
0 komentar:
Posting Komentar